Keskustelun lähtökohdan pitäisi ollatutkielma, jonka mukaan kaikki tiedoston sisältämät tiedot ovat tietty looginen rakenne. Se on perusta ohjelmistoille, joiden avulla jokainen tietty tiedosto käsitellään. Tiedostojärjestelmän organisointi mahdollistaa esimerkiksi tietojen oikean näyttämisen näytöllä, tarjoaa valinnan, korjaamisen vaihtoehtoja. Tämä saavutetaan sillä, että jokaisen tällaisen järjestelmän elementti on ainutlaatuinen koodijakso, joka erottaa sen toisesta elementistä. Järjestelmän rakenteen tallentaminen ja ylläpitäminen tasaisessa tilassa saadaan joko vastaavasta sovelluksesta tai itse tiedostojärjestelmästä.
Ensimmäisellä vaihtoehdolla kaikki menettelyt tiedoston kanssasuorittaa sovelluksen, joka aloittaa asianmukaiset pyynnöt järjestelmälle. Tätä menetelmää käytetään laajasti nykyaikaisissa tiedostojärjestelmissä - Windows, NetWare. Toisessa tiedoston rakenteen tarjoaa itse käyttöjärjestelmä, joka tunnistaa sen yksilöivänä kooditietojen sekvenssinä. Tätä varten jokaisessa käyttöjärjestelmässä on tietoja kunkin tiedostotyypin rakenteesta.
Fyysinen organisaatio on malli tiedostojen sijainnista tallennusvälineellä (fyysinen laite). Tärkeimmät parametrit tällaisen organisaation tehokkuudesta ovat:
- tiedon saatavuuden nopeus
- osoitetietojen arvo;
- levyn pirstoutumisen taso;
- enimmäiskoko.
Tällainen indikaattori, kuten hajanaisuus, heijastaa kuinka häiriintynyt tiedostojärjestelmän järjestäminen johtuu samantyyppisten tiedostojen jakautumisesta levytilaan.
Itse kiintolevy on rakennettu magneettiseksilevyt, jotka on suunniteltu tallentamaan niistä tietoa. Tallennusprosessi koostuu tiettyjen merkkien levittämisestä levyjen pintaan, kun taas epätarkat merkinnät aiheuttavat virheen levytiedostojärjestelmässä. Virheet on korjattava itse järjestelmän käytettävissä olevilla ohjelmilla ja työkaluilla. Jos virheitä ei korjata, levy alustetaan yleensä ja kaikki sen tiedot poistetaan. Levytiedostojärjestelmä sisältää klusterit, joita pidetään levytilan vakioyksikköinä. Klusteri on tietyn määrän solu, joka osallistuu siihen sisältyvän tiedon käsittelyyn. Tämän solun koko määritetään joko automaattisesti tai loogisen muotoilun avulla. Klusteriklusteri muodostaa levyosion, ts. osa fyysistä väliainetta. Levyllä olevan tiedostojärjestelmän ainutlaatuinen järjestely sisältää fyysisen laitteen osioinnin
- tietokoneeseen asennetun tietyn käyttöjärjestelmän osassa oli kokorajoituksia;
- varata tilaa käyttäjien kesken tai jakaa levy temaattisiksi osioiksi;
- On välttämätöntä asentaa toinen käyttöjärjestelmä.
Nykyaikaiset käyttöjärjestelmät voivat tukea tehokkaastierityyppisiä väliseiniä, jakamalla ne toiminnallisen tarkoituksensa mukaan. Yleisin tyyppijakamismalli on ensisijaisen, ensisijaisen ja toissijaisen osion luominen.
Levyn osiointi suoritetaan menettelyä noudattaenlooginen muotoilu. Tämä tiedostojärjestelmäorganisaatio on prosessi, jolla mediatila muutetaan tietyn käyttöjärjestelmän vaatimuksiin. Tässä tapauksessa on erittäin tärkeää noudattaa muotoilustandardeja, jotka vahvistavat levyjen numerointia, nimeämistä ja tilaa koskevat säännöt. Useimmiten nykyaikaiset käyttöjärjestelmät jakavat levyn kahteen alueeseen - järjestelmä- ja datatilaan (data). Ensimmäistä käytetään tietoalueen hallintaan. Toinen on tarkoitettu tiedostojen ja hakemistojen tietojen sijoittamiseen. Tietokoneen käynnistyksen aikana käytetyt tiedot sijaitsevat aina levyn ensimmäisessä (käynnistys) sektorissa.