Mūsdienu Azerbaidžāna saskaņā arpašreizējā konstitūcija ir laicīga valsts. Reliģija un valsts ir oficiāli atdalītas viena no otras, tomēr tās loma sabiedrībā ir diezgan liela. Valsts ir pieņēmusi un ir spēkā likumi, kas nosaka reliģiju juridisko statusu sabiedrībā un pilsoņu stāvokli saistībā ar reliģijām. Azerbaidžāna, kuras reliģija ir daudzkonfesionāla, pieder vairākām samērā tolerantām valstīm starpreliģiju attiecībās.
Līdz šim galvenā reliģijaAzerbaidžāņi - šītais islams. Saskaņā ar statistiku šī reliģiskā piederība izpaužas vairāk nekā 99,2% iedzīvotāju, un ir daži no iedzīvotājiem, kas ievēro islāma sunnītu filiāli (apmēram 15%). Islāms Azerbaidžānā un citās Aizkaukāsas valstīs vada Gazešu musulmaņu garīgo pārvaldi, kas tika izveidota pēc Staļina iniciatīvas 1943. gadā. Šīs iestādes galvenais elements ir Baku. Kopš 1980. gada to vada Šeih-ul-Islam Haji Allahshukur Pasha-zade. Pēc PSRS sabrukuma un Azerbaidžānas neatkarības iegūšanas šī garīgā organizācija saņēma jaunu nosaukumu - Kaukāza Musulmaņu biroju. Saskaņā ar tās jurisdikciju valsts teritorijā atrodas 1802 mošejas, turklāt mītnīcas ir Lenkoran (75) un Massalin (12) mošejas.
Kristietība ir otrā vieta Azerbaidžānāpēc ticīgo skaita. Kā pašai Azerbaidžānas valsti kristietības reliģijai ir ilga vairāk nekā 2000 gadu vēsture. Tās izplatīšana ir tieši saistīta ar apustuļa Bartolomeja darbībām. Saskaņā ar tradīciju viņš bija pirmais no Kristus mācekļiem, kurš apmeklēja šo zemi un uzņēma savu kristiešu ticību saviem cilvēkiem. Baku ir vieta, kur apustulis Varfolomeja izlaidis asinis un nomira par ticību. Līdz šai dienai šis svētnīca ir svētceļojumu un pielūgsmes vieta divus tūkstošus gadu. Visplašāk izplatīt Pareizticīgā kristietība teritorijā mūsdienu Azerbaidžānu 4.gadsimtā tajā pašā laikā tika izveidota Autokefālās Baznīca Albānijā (vārds, viņa saņēma saskaņā ar toreizējā nosaukumu zemes - Kaukāza Albānijā). Tagad valstī ir 5 pareizticīgo katedrāles, galvaspilsētā ir trīs no tām.
Katolisms valstī parādījās vēlāk - tikai iekšā14. gadsimts, tā izplatība ir saistīta ar katoļu rīkojumu misionāriem Transkaukāza teritorijā, kas arī konfiscēja Azerbaidžānu. Katolicisma reliģija veicināja Eiropas kultūras izplatīšanos, bija skolas, katoļu klosteri. 2002.gadā pāvests Jānis Pāvils II apmeklēja Azerbaidžānu. Baku šodien darbojas katoļu katedrālēs, patversmē un Labdarības māsu ordenē.
Protestantismu Azerbaidžānā pārstāv 25 evaņģēliski kristiešu baptistu draudzes, kurās tiek uzklausīti apmēram 3000 ticīgie.
Jūdaismu pārstāv trīs ebreju kopienas,kas, neskatoties uz teritoriālo vienotību, ir diezgan ietekmīga sabiedriskās dzīves institūcija valstī. Jo īpaši pēc viņas iniciatīvas Azerbaidžānā darbojas Sohnut aģentūra, dažādas organizācijas un padomes, kas nodarbojas ar ebreju kultūras mantojuma saglabāšanu, reliģiskās skolas, un darbojas jūdaisma kultūras centrs. Kapitālē ir 6 sinagogas, un to jaunākais, kas tika atvērts 2003.gadā, tiek uzskatīts par vienu no lielākajiem Eiropā.
Azerbaidžānas iezīme šajā ziņā irtāda reliģiskā tendence kā zoroastriālisms paliek. Tā izcelsme atgriežas pirmajā tūkstošgadē, kad Zoroastriālisms iekļuva Azerbaidžānā. Reliģija Zoroastriisms gandrīz tūkstoš gadus bijusi ietekmīgākā šajās zemēs. Tas nav pilnīgi nejaušs, iespējams, pēc dažu ekspertu domām, vārds "Azerbaidžāna" tulkojumā nozīmē "Mūžīgā ugunsgrēka zeme". Un šodien Zoroastriskās tradīcijas ir populāras Azerbaidžānā. Tās parādās arī tradicionālo citu reliģisko brīvdienu laikā, piemēram, spēlēs, ceremonijās, kuras ir īpaši populāras jauniešu vidū lauku apvidos.