Pirmieji Tomsko regiono gyventojaipasirodė prieš kelis tūkstančius metų. Dvi paleolito vietos Tomsko mieste ir Mogichino kaime jau seniai žinomos mokslininkams. Galiausiai teritorija buvo įvaldyta 3 000 m. Pr. Kr. e. neolito pabaigoje.
Senovėje šioje teritorijoje buvo suformuotos šios kultūros:
10-ajame amžiuje kaimyninės gentys užėmė regiono teritoriją.
Tatario-mongolio invazijos metu teritorija visiškai priklausė Mongolų imperijai. 14-ajame amžiuje jie buvo nepriklausomas Sibiro kanaatas.
XVI a. Pabaigoje Tomsko regiono teritorijoje buvo pastatyta pirmoji Narymo tvirtovė.
Boriso Godunovo prašymu čia 1604 kazokai įkūrė Tomsko miestą, kurį Tomsko provincija vis dar didžiuojasi. Būtent čia, pasak legendos, Aleksandras I mirė, paslėpdamas Fyodoro Kuzmicho vardu.
1629 m. Tomskas tapo pagrindiniu regiono miestu, kuriam priskirti šie miestai:
Po Sibiro trakto statybos miestas tapo svarbus prekybai ir dėl to palaipsniui išsiplėtė.
1804 m. Tomsko provinciją Aleksandro I dekretu vadovavo naujas centras - Tomsko miestas.
Įtraukta sritis:
Prasideda miesto akmens pastatas. XIX a. Pabaigoje yra 50 namų, 8 bažnyčios ir Trejybės katedra.
Tomsko emblema tampa emblema, kurioje žali fone vaizduojamas arklys su vainikinių lapų vainiku.
XIX a. Pabaigoje Tomsko provincija buvo prijungta prie kitų Sibiro geležinkelio regionų.
Karo metais į Tomską evakuota apie 30 gamyklų, kurios pramoniniu požiūriu labai išplėtė miestą.
Buvo įtrauktos šios pramonės šakos:
1941 m. Tomsko provincija suteikė Vakarų fronto karo lauko medicininę bazę ir mokė vadus 2 artilerijos mokyklų pagrindu.
Po karo Tomskas tapo vienu iš branduolinių tyrimų centrų.
1958 m. Regione pradėjo veikti pirmoji atominė elektrinė.
Šioje srityje plėtojami naftos ir dujų telkiniai.
Tomskas yra pripažintas Rusijos mokslų akademijos mokslinis centras.