Перші мешканці на території Томської областіз'явилися ще кілька тисяч років тому. 2 палеолітичні стоянки в місті Томську і селі Могічін відомі вченим давно. Територія була остаточно освоєна в 3 000 до н. е. в кінці неоліту.
У давнину на цій території сформувалися такі культури:
У 10 столітті територія області займали кочові племена.
За часів навали татаро-монгол, територія повністю увійшла до складу Монгольської імперії. А в 14 столітті они склали самостійне Сибірське ханство.
В кінці 16 століття на території Томської області побудована перша фортеця Нарим.
За велінням Бориса Годунова тут в 1604 році козаками закладено місто Томськ, яким до цих пір пишається Томська губернія. Саме тут за переказами помер Олександр I, ховаючись під іменем Федора Кузмича.
У 1629 році Томськ стає головним містом області, до якого приписувалися такі міста:
Після будівництва Сибірського тракту місто придбало важливе значення для торгівлі і поступово розширювався завдяки цьому.
У 1804 році Томська губернія очолив новим центром - містом Томському за указом Олександра I.
Область включила у собі:
Починається кам'яна забудова міста. До кінця 19 століття це 50 будинків, 8 церков і Троїцький собор.
Гербом Томська стає емблема, де на зеленому тлі зображено кінь з короною в дубових листках.
В кінці 19 століття Томська губернія була з'єднана з іншими областями сибірською залізницею.
У роки війни в Томськ було евакуйовано близько 30 заводів, що дуже сильно розвинуло місто в індустріальному плані.
Були задіяні галузі:
Саме Томська губернія в 1941 році надала польову військово-медичну базу Західного фронту і готувала командний склад на базі 2 артилерійських училищ.
Після війни Томськ стає одним з центрів ядерних досліджень.
У 1958 році на території області введено в дію перша атомна станція.
На цій території ведуться розробки нафтових і газових родовищ.
Томськ - визнаний науковий центр Російської Академії Наук.
