После правления Василия Шуйского встал вопрос об зміцненні єдиного російської держави. Необхідно було для цього зробити кілька рішучих дій - покінчити з децентралізацією, до кінця сформувати загальнодержавний апарат і розширити територію країни. Василь III поклав лише початок цього процесу, а вирішити проблеми залишалося його синові Івану, якому на момент смерті батька було лише три роки.
У 1546 році майбутній Іван IV досягп'ятнадцятиріччя (в цьому віці наступало повноліття), і влада від матері цілком і повністю перейшла до нього. У 1547 році він прийняв титул царя. Вінчання на царство проходило в Успенському соборі. У цьому ж році відбулася низка пожеж і народне повстання, які довели, що в суспільстві існує протистояння бояр і народу. Іван IV почав посилену боротьбу проти боярської влади, наближаючи до себе людей з інших станів. Коло наближених отримав назву "Вибрана Рада", до складу якої входили такі особи, як Андрій Курбський, митрополит Макарій і протопоп Сильвестр, Олексій Адашев. Вони здійснили такі реформи, які уславили час правління Івана:
1. У 1550 році був виданий так званий Судебник - звід законів, який зміцнив царську владу.
2. В армії з'явилося Стрілецьке військо.
3. Була реформована система фінансів.
4. У місцевому та центральному управлінні скасували годування і ввели систему наказів.
5. Була проведена реформа церкви.
Зміни призвели до того, що за короткий час вдержаві помітно виріс авторитет влади. Обрана Рада і її система правління виявилися найбільш ефективними. Всі рішення, прийняті в 50-х роках того століття, були спрямовані на централізацію влади царя. Незважаючи на те що Обрана Рада і її реформи позначилися позитивно на державі і зміцнили царську владу, в 1560 році вона була розпущена. Причин цьому було декілька. Цар перестав довіряти своїм наближеним людям, особливо коли запідозрив зраду після втечі в Польщу Андрія Курбського. Також наростали розбіжності в поглядах у зовнішній і внутрішній політиці.
У 1565 році Іван IV заснував новий государева доля - опричнину, до складу якої увійшли економічно розвинені території.
Однак панування терору виявилося меншефективним, ніж Обрана Рада і її політика. У підсумку цар скасував опричнину в 1572 році. Після цього в країні відбулися політична і економічна кризи 70-х-80-х років. Крім цього, можна говорити про розорення селянських господарств, які були основою економіки країни - на них наголошувала Обрана Рада. Опричнина багато в чому зумовила загальну кризу влади і наступає Смутні часи.