Първите обитатели на област Томсксе появи преди няколко хиляди години. Два палеолитни обекта в град Томск и село Могичин са били известни на учените отдавна. Територията най-накрая е усвоена през 3 000 г. пр. Хр. д. в края на неолита.
В древността на тази територия се формират следните култури:
През 10-и век номадските племена заемат територията на региона.
По време на инвазията на татарско-монголската територия територията е изцяло включена в монголската империя. И през 14 век те са представлявали независим сибирски ханатет.
В края на 16 в. Първата територия на крепостта Нарим е построена на територията на област Томск.
По повод Борис Годунов тук през 1604 г. казаците основават град Томск, за който провинция Томск все още се гордее. Именно тук, според легендата, Александър I умира, скривайки се под името на Фьодор Кузмич.
През 1629 г. Томск става главният град на региона, на който се приписват следните градове:
След изграждането на сибирския тракт, градът става важен за търговията и постепенно се разширява благодарение на това.
През 1804 г. провинция Томск е оглавявана от нов център - град Томск с постановление на Александър I.
Районът включва:
Каменната сграда на града започва. До края на XIX в. Има 50 къщи, 8 църкви и катедралата Троица.
Емблемата на Томск става емблема, където е изобразен конник с корона от дъбови листа на зелен фон.
В края на XIX век провинция Томск е свързана с други региони на Сибирската железница.
През войната години около 30 фабрики са евакуирани в Томск, който значително развива града в промишлени условия.
Бяха включени следните отрасли:
Точната провинция Томск през 1941 г. осигуряваше военната медицинска база на Западния фронт и обучила командирите на базата на 2 артилерийски школи.
След войната Томск стана един от центровете за ядрени изследвания.
През 1958 г. първата атомна електроцентрала започва да работи в региона.
В тази област се разработват нефтени и газови находища.
Томск е признат научен център на Руската академия на науките.