Polazna točka naše rasprave trebala bi bititeza da su svi podaci koje datoteka sadrži određene logičke strukture. Služi kao osnova za softver s kojim se obrađuje svaka određena datoteka. Organizacija datotečnog sustava omogućuje, na primjer, ispravno prikazivanje informacija na zaslonu, pruža mogućnosti za odabir, ispravak. To se postiže činjenicom da je svaki element takvog sustava jedinstveni niz kodova koji ga odvaja od drugog elementa. Očuvanje i održavanje u stabilnom stanju strukture sustava osigurava odgovarajuća aplikacija ili sam datotečni sustav.
U prvoj opciji, svi postupci s datotekomizvršava aplikaciju koja pokreće odgovarajuće zahtjeve prema sustavu. Ova se metoda široko koristi u modernim datotečnim sustavima - Windows, NetWare. U drugom, strukturiranje datoteke osigurava sam OS, koji je prepoznaje kao jedinstveni niz zapisa koda. Da biste to učinili, svaki OS ima podatke o strukturi svake vrste datoteke.
Fizička organizacija je model smještaja datoteka na mediju (fizičkom uređaju). Najvažniji parametri učinkovitosti takve organizacije su:
- brzina pristupa informacijama;
- količinu podataka o adresi;
- razina fragmentacije diska;
- najveća veličina datoteke.
Pokazatelj poput fragmentacije odražava koliko je poremećena organizacija datotečnog sustava zbog disperzije datoteka iste vrste na diskovnom prostoru.
Sam tvrdi disk izrađen je od magnetaploče namijenjene za snimanje bilo kakvih podataka o njima. Postupak snimanja sastoji se u nanošenju određenih oznaka na površinu ploča, dok se netočnim označavanjem javlja pogreška u datotečnom sustavu diska. Pogreške treba ispraviti pomoću dostupnih programa i alata samog sustava, ako se pogreške ne isprave, disk se obično formatira, a svi podaci s njega brišu. Diskovni datotečni sustav uključuje klastere koji se smatraju standardnom jedinicom prostora na disku. Grupa je ćelija određene veličine koja sudjeluje u obradi informacija koje se u njoj nalaze. Veličina ove ćelije određuje se automatski ili logičkim oblikovanjem. Skup klastera čini particiju diska, tj. dio fizičkog medija. Jedinstvena organizacija datotečnog sustava na disku uključuje particioniranje fizičkog uređaja na particije kako bi:
- postojala su ograničenja u pogledu veličine određenog OS -a instaliranog na računalu;
- raspodijeliti prostor među korisnicima ili podijeliti disk na tematske dijelove;
- morate instalirati drugi operacijski sustav.
Suvremeni operacijski sustavi sposobni su učinkovito podržatinajrazličitije vrste odjeljaka, distribuirajući ih prema funkcionalnoj namjeni. Najčešći model za odvajanje tipova je stvaranje primarne, primarne i sekundarne particije.
Particioniranje diska izvodi se pomoću postupkalogičko oblikovanje. Ova organizacija datotečnog sustava je proces transformacije medijskog prostora u skladu sa zahtjevima određenog operacijskog sustava. Istodobno, vrlo je važno pridržavati se standarda oblikovanja koji utvrđuju pravila za numeriranje diskova, njihovo imenovanje i utvrđivanje statusa. Najčešće, moderni operacijski sustavi dijele disk na dva područja - sustav i podatkovni prostor (data). Prvi se koristi za kontrolu područja podataka. Drugi je za postavljanje informacija o datotekama i direktorijima. Podaci korišteni tijekom početnog pokretanja računala uvijek se nalaze na prvom (pokretačkom) sektoru diska.