Prvi Rusi koji su se pojavili na ovim zemljama,postali su kozaci iz odreda pionira Vasilija Pojarkova, koji je ovdje došao 1644. godine. Sredinom 17. stoljeća na lijevoj obali Amura osnovan je prvi zatvor, ali zbog nemirnih odnosa Rusa i kineske države taj je zatvor napušten krajem stoljeća. Buduća prijestolnica Amurske regije, kako se danas vjeruje, osnovana je 1856. godine, kada je ovdje osnovana vojna pošta Ust-Zeya. Činjenica je da je u to vrijeme konačno sazrela potreba za proglašenjem carskih prava na posjed lijeve obale Amura. Blagoveshchensk je započeo kao pogranična tvrđava, osnovana tijekom širenja državnih teritorija - zajednička povijest mnogih ruskih gradova.
Granična ispostava
Tijekom druge polovice 19. stoljećaBlagoveshchensk se sve više jačao kao uporište ruske civilizacije i državnosti na Dalekom istoku. U prvim godinama svog postojanja, budući glavni grad Amurske regije intenzivno je proširio svoj teritorij zbog dolaska novih kozačkih pukovnija, koje su sa svojim obiteljima ostale za stalno nastanjenje. 1858. godine ovdje je osnovana prva pravoslavna crkva Navještenja Presvete Bogorodice. Inače, upravo je imenom hrama selo kasnije steklo svoje ime. Iste godine, kao rezultat Aigunskog sporazuma između Rusije i Kine, ruska je strana prepoznala cijelu lijevu obalu Amura, a selo je dobilo službeno priznanje od dinastije Qing. U prosincu 1858. na državnim kartama otadžbine pojavila se karta Amurske regije, a Blagoveshchensk je postao njeno administrativno središte. Stvaranje regije dogodilo se najvišim carskim ukazom Aleksandra II.
U drugoj polovici stoljeća grad je postajao sve više i višeintenzivno se razvija. Šezdesetih godina ovdje su otkrivena nalazišta zlata, što daje značajan poticaj rastu prosperiteta i statusa grada. Riječno mjesto sve više pretvara Blagoveshchensk u značajno brodarsko središte. Poljoprivreda u regiji razvija se velikom brzinom. Sve to, naravno, pozitivno utječe na razvoj urbane infrastrukture i rast lokalnog stanovništva. Glavni grad Amurske regije dobiva veliku važnost u teškoj industriji zemlje. Dakle, 1888. godine ovdje se pojavila prva ljevaonica željeza, a početkom 20. stoljeća kroz grad je položena pruga. Naravno, stanovništvo Blagoveshchenska oduvijek je imalo velik udio Kineza. Nemirni početak novog stoljeća kako u Rusiji tako i u Nebeskom carstvu donio je u grad niz nacionalnih sukoba. Tako je 1900. godine takozvani Boxer-ov ustanak doveo do vojnih sukoba između Rusa i Kineza na Dalekom Istoku. Kao rezultat ovih događaja, potonji su djelomično uništeni i velikim dijelom protjerani iz grada.
Sovjetsko razdoblje
Tijekom građanskog rata, glavni grad regije Amurneko su ga vrijeme okupirale japanske trupe, koje su pokušavale izvući vlastitu korist i prisvojiti dio teritorija bivšeg carstva. Međutim, protjerali su ih lokalni partizani u ljeto 1920. Od 1922. Blagoveshchensk sa susjednim teritorijima postao je dio sovjetske države. U 1920-30. Godini ovdje se opet aktivno razvijala teška i laka industrija. Specifičnost pograničnog grada ostavila je traga na lokalnu trgovinu - grad je postao jedno od glavnih mjesta krijumčarenja. Tijekom Velikog domovinskog rata Daleki je istok bio jedna od važnih sastavnica domaće industrije koja je radila za potrebe fronte. I u poslijeratnom razdoblju, Blagoveshchensk je dugo ostao grad zatvoren za ulazak, budući da su se ovdje nalazila strateški važna poduzeća. Novo doba došlo je tek s perestrojkom sredinom 1980-ih.
