V biológii popísať konkrétny organizmus,ktorá patrí do kráľovstva zvierat, húb alebo rastlín, bola vyvinutá jej vlastná nomenklatúra. Odráža príslušnosť k jednému druhu v závislosti od charakteristík morfológie a vzhľadu. Kritériá označovania druhov sa vzťahujú na zvieratá v závislosti od ich schopnosti produkovať plodné potomstvo počas oplodnenia. Tieto vzorce sa však vzťahujú iba na tieto organizmy, zatiaľ čo mikróby sa nedajú takto klasifikovať.
Kvôli prítomnosti obrovského množstvaorganizmov s morfologickými vlastnosťami, ale s rôznymi biochemickými a imunologickými vlastnosťami, nie je možné na pomenovanie použiť štandardnú nomenklatúru. V dôsledku toho sa zavádza koncepcia, ako je kmeň. Je to čistá kultúra mikróbov, ktorá bola schopná izolovať a izolovať na určitom mieste v určitú hodinu.
Každý mikrób, ktorý patrí k jednémukmeň podobný podobnému zástupcovi podľa biochemických, morfologických, imunologických a genetických kritérií. Ale v medziach jedného bakteriálneho druhu sa takáto analógia nepozoruje. Kmeň je preto flexibilnejším názvom pre mikrobiálnu kultúru. Pretože rýchla výmena genetického materiálu (mutácia) vedie k objaveniu sa nových organizmov v rámci druhu, ale s rôznymi vlastnosťami, umožňuje táto definícia presnejšie charakterizovať faktory patogenity a virulencie v tejto definícii.
Existujúca nomenklatúra baktérií to umožňujeklasifikácia druhov organizmov, ale ne charakterizuje ich nové vlastnosti. Tieto sa objavujú v dôsledku rýchlych mutácií, získavania nových vlastností, vrátane patogénnych pre ľudí, domáce zvieratá a rastliny, ako aj ďalších mikróbov. Príklad nomenklatúry na príklade Escherichia coli vyzerá takto: kráľovstvo - baktérie, typ - proteobaktérie, trieda gama-proteobaktérií, poriadok - Enterobacteriales, rodina enterobaktérií. Rod je Escherichia a druh je Escherichia colli. Existuje však veľa bakteriálnych kultúr druhov Escherichia colli, ktoré vykazujú rôzne vlastnosti. Sú izolované v samostatných kmeňoch baktérií a majú ďalší názov. Napríklad Escherichia colli O157: H7.
Sama E. coli je prítomná v črevečlovek a nespôsobuje ochorenie, ale kmeň O157: H7 je výlučne patogénny v dôsledku prítomnosti väčšieho počtu virulenčných faktorov. Za posledných 5 rokov bola poznačená epidémiou enterotoxických chorôb.
Koncept kmeňa je flexibilný názov pre organizmy sidentické vlastnosti, ktoré boli identifikované a potom identifikované a opísané v konkrétnej oblasti v konkrétnom čase. Po svojom priebehu môže vírus získať nové vlastnosti vďaka antigénnemu driftu. Takto sa vytvorí nový vírusový kmeň, pravdepodobne patogénnejší ako jeho pôvodca.
Môžete jasne ukázať vznik nových kmeňovnapríklad vírus chrípky. Patrí do rodiny orthomyxovírusov a nazýva sa HxNy v závislosti od antigénov (hemaglutiníny a neuraminidázy). X a Y sú číselné hodnoty odrážajúce prítomnosť antigénov. Príkladom je H5N1, ktorý je známy pre nedávnu epidémiu prasacej chrípky s rýchlo progredujúcou hemoragickou pneumóniou. Teoreticky sa z tohto kmeňa môže vyvinúť nový a nebezpečnejší kmeň v dôsledku rovnakého antigénneho posunu.
Zo všetkých mikróbov sú plesnenajmenej variabilné, hoci ich biochémia je tiež komplexná. V dôsledku zložitejšej štruktúry ako baktérie a vírusy a tiež kvôli nedostatku mechanizmov na rýchly génový prenos sa počet nových kmeňov húb mierne zvyšuje. Existuje tiež názor, že akýkoľvek nový nedávno nájdený fungálny kmeň je už existujúcim organizmom, ktorý výskumníci jednoducho nenarazili na vedcov.
Podobná situácia existuje v kráľovstve.prvoky. Ich schopnosť mutovať je malá, pretože pravdepodobnosť, že sa nové kmene objavia rýchlo, je extrémne malá. Stále sa však objavujú nové varianty organizmov toho istého druhu. Zrejme preto existovali aj skôr, ale neboli objavené.
