Основу строения протеинов и протеидов составляет bir polipeptit zinciri ve bir protein molekülü bir, iki veya birkaç zincirden oluşabilir. Bununla birlikte, biyopolimerlerin fiziksel, biyolojik ve kimyasal özellikleri, sadece "anlamsız" olabilecek genel kimyasal yapı tarafından değil, aynı zamanda protein molekülünün diğer organizma düzeylerinin varlığıyla da belirlenir.
Protein birincil yapısı ile belirlenirnicel ve nitel amino asit bileşimi. Peptid bağları birincil yapının temelidir. İlk kez bu hipotez 1888'de A. Ya Danilevsky tarafından ifade edildi ve daha sonra varsayımları E. Fisher tarafından gerçekleştirilen peptitlerin sentezi ile doğrulandı. Protein molekülünün yapısı A. Ya, Danilevsky ve E. Fisher tarafından detaylı olarak incelenmiştir. Bu teoriye göre, protein molekülleri, peptid bağlarıyla bağlanan çok sayıda amino asit tortusundan oluşur. Bir protein molekülü bir veya daha fazla polipeptit zincirine sahip olabilir.
Proteinlerin primer yapısının kimyasal maddeler ve proteolitik enzimler kullanılarak incelenmesi. Bu nedenle, Edman yönteminin kullanılması, terminal amino asitleri tanımlamak için çok uygundur.
Protein ikincil yapısı gösterirprotein molekülünün uzaysal konfigürasyonu. Aşağıdaki ikincil yapı tipleri ayırt edilir: alfa-helisel, beta-sarmal, kollajenik sarmal. Bilim adamları, alfa sarmalının peptitlerin yapısının en karakteristik özelliği olduğunu bulmuşlardır.
Protein sekonder yapısıhidrojen bağlarının yardımı. Sonuncusu, bir peptid bağının elektronegatif azot atomuna bağlı hidrojen atomları ve ondan dördüncü amino asidin karbonil oksijen atomu arasında ortaya çıkar ve bunlar sarmal boyunca yönlendirilir. Enerji hesaplamaları, bu amino asitlerin polimerizasyonu sırasında, doğal proteinlerde bulunan sağ alfa sarmalının daha etkili olduğunu göstermektedir.
Sekonder Protein Yapısı: Beta Katlanmış Yapı
Betadaki polipeptid zincirleri tamamen katlanıruzattı. Beta katları, iki peptid bağının etkileşimi ile oluşur. Belirtilen yapı, fibriller proteinlerinin (keratin, fibroin, vb.) Karakteristiğidir. Özellikle, beta-keratin, zincirler arası disülfit bağları ile daha da stabilize edilen paralel bir polipeptit zincirleri düzeneği ile karakterize edilir. İpek fibroininde, bitişik polipeptit zincirleri antiparaleldir.
Sekonder Protein Yapısı: Kollajen Helix
Eğitim üç spiral zincirden oluşmaktadır.çubuk şeklinde olan tropocollagen. Spiral zincirler döner ve bir süper bobin oluşturur. Spiral, bir zincirin amino asit kalıntılarının peptid amino gruplarının hidrojeni ve diğer zincirin amino asit kalıntılarının karbonil grubunun oksijeni arasında ortaya çıkan hidrojen bağları ile stabilize edilir. Sunulan yapı, kolajene yüksek mukavemet ve elastikiyet verir.
Tersiyer protein yapısı
Kendi doğal durumlarındaki proteinlerin çoğu, amino asit radikallerinin şekli, boyutu ve polaritesi ile amino asit dizisi tarafından belirlenen çok kompakt bir yapıya sahiptir.
Oluşum süreci üzerinde önemli etkihidrofobik ve iyonik etkileşimler, hidrojen bağları, vs. bir proteinin veya üçüncül yapısının bir doğal konformasyonunu gösterir, bu kuvvetlerin etkisiyle, protein molekülünün termodinamik açıdan uygun bir konformasyonu ve stabilizasyonu sağlanır.
Kuaterner yapı
Bu tip moleküler yapı, birkaç alt birimin, tek bir kompleks moleküle birleştirilmesinin bir sonucu olarak ortaya çıkmaktadır. Her alt birim, birincil, ikincil ve üçüncül yapılar içerir.